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Master Biologie informatique/bioinformatique

Domaine ministériel >
Sciences, Technologies, Santé
Composante de rattachement >
UFR SCIENCES DU VIVANT
Lieu de formation >
Université Denis Diderot
Capacité d'accueil >
25
Niveau d'étude visé >
BAC+ 5
Durée de la formation >
2 ans
ECTS >
120
Organisation des enseignements >
Formation continue
Formation initiale
VAE >
Oui
Formation à distance >
Non

Présentation

Formation pluridisciplinaire reposant sur trois domaines clés : Biologie, Biostastistique et Informatique. Sur un socle solide de connaissances en biologie, l'objectif est de doter les étudiants d'une compétence en informatique  pour gérer, analyser, modéliser des données biologiques à grande échelle. La maîtrise de langage de programmation, l'algorithmie, la création et la gestion de bases de données, sont des éléments clés de la formation. La maîtrise des méthodes statistiques adaptées à la fouille et au traitement des données complète le socle de compétences visées.

Parmi les modalités d'évaluation, la réalisation de projets incluant à la fois un aspect méthodologique et informatique sur une problématique biologique donnée  permet aux étudiants d'aborder concrètement la gestion d'un projet bioinformatique.

Pour plus d’information : http://biteach.sdv.univ-paris-diderot.fr

Objectifs

Compte tenu de l'évolution très rapide des technologies "omiques", l'aptitude à l'autoformation à travers la veille technologique et la maîtrise de la littérature constitue l'un des objectifs importants de la formation de même que l'autonomie face à la gestion d'un projet.

 

Compétences visées

Compétences fondamentales :

  • Acquérir des connaissances approfondies en biologie, en particulier génomique, transcriptomique, structure et physico-chimie des molécules biologiques.
  • Comprendre et analyser une problématique biologique et à résoudre ces problèmes à l'aide de méthodes bioinformatiques et de modélisation.
  • Maîtriser un ou plusieurs langages informatiques, concevoir des bases de données et de déployer des outils web.
  • Maîtriser des méthodes de modélisation.
  • Maîtriser des méthodes d’analyses biostatistiques

Compétences transversales :

  • Savoir s'exprimer   en anglais et maîtriser le langage scientifique du domaine
  • Maîtriser les supports de communications (écrits et oraux)
  • Avoir le sens de l'organisation, rigueur et méthode
  • Avoir  une capacité de synthèse.
  • Avoir une capacité à convaincre et défendre un projet.

 

Enseignements

Contenu de la formation

Pour le M1 (60 ECTS): deux parcours sont proposés, un parcours "Bioinformatique" pour les étudiants ayant des notions d'informatique et un parcours "Informatique pour biologistes", pour les autres. Le semestre 1 assure une formation de base, le semestre 2 propose la mise en pratique de ces notions avec une spécialisation et un stage de 3 mois.
Pour le M2 (60 ECTS): Le semestre 1 est dévolu aux
enseignements théoriques et pratiques. Ces derniers sont réalisés
essentiellement sous forme de projets dont les difficultés vont croissant.
L'UE "Projet" correspond à un travail autour d'un thème donné et nécessite la mobilisation d'une véritable équipe (plus de 2 étudiants). La plupart des présentations et rédactions se font en anglais. Le semestre 2 correspond à un stage de 6 mois en laboratoire ou entreprise.
Un effort important a été réalisé pour harmoniser la formation entre le M1 et le M2 en mettant l’accent sur la progressivité des enseignements. Différentes UE  sont déclinées par niveau (élémentaire dit de base, renforcé ou I, expert ou II) entre le M1 et le M2. 

Afin de faciliter l’intégration et optimiser les orientations, le système d’options est renforcé. Il inclut différentes UE disponibles au sein de l’établissement mais aussi avec des établissements proches après accord des responsables pédagogiques concernés.  


Organisation de la formation

Stage et Tutorat

Stage >
Obligatoire

Admissions

Titres requis :
En master 1re année :

  • Licence 3e année en Sciences du Vivant
  • Licence 3e année en Informatique et Physique-Chimie avec un fort intérêt pour les Sciences du Vivant
  • Formation en Pharmacie
  • Diplôme équivalent à un Bac + 3 et/ou expérience professionnelle

En master 2e année

  • M1 Informatique-Bioinformatique
  • M1 In Silico Drug Design (ISDD)/Informatique
  • M1 Physique-Chimie avec un fort intérêt pour les Sciences du Vivant
  • Titre équivalent à un BAC +4  et/ou expérience professionnelle

La remise à niveau effectuée en M1 et en M2 permet d’accepter des étudiants provenant d’autres formations, pourvu que l’intérêt pour la biologie ou l’informatique soit manifeste.

Modalités de candidature

Vous souhaitez déposer une demande d’inscription à l’université Paris Diderot pour 2019-20.

Inscription annuelle :

Profils et statuts spécifiques :

Et après

Poursuite d'études

Les 4 dernières années, les étudiants souhaitant poursuivre en thèse ont pu le faire dans la plupart des cas dans les laboratoires correspondant au stage de M2, clairement des laboratoires bioinformatiques.


Insertion professionnelle

En ce qui concerne l’intégration professionnelle, la diversité des secteurs d’emplois est sensiblement plus grande (entreprises de biotechnologie et des groupes pharmaceutiques). Le niveau correspond à celui d’ingénieur d’étude ou chef de projet.

A deux ans, la plupart des étudiants issus de la formation ont obtenus un CDD (18 mois au moins) ou des CDI en tant que doctorant, ingénieur d'étude dans de grands centres de recherche (INRA, Institut Pasteur, Institut Curie, Inserm) mais aussi des CDI dans des entreprises (SOGETI, ALTEN, Syngenta Seeds, ISoft, Datavance, OpenSphere). Pour la grande majorité, ils poursuivent une activité centrée sur la bioinformatique. Certains d'entre eux ont été engagés pour leurs compétences en informatique ou statistique.

Contacts

Responsable(s) de la formation

Catherine Etchebest
0144493058
Delphine Flatters
0157278393
Jean-Christophe Gelly
0158415168
Gautier Moroy
0157278385

Scolarité formation initiale

Virginie Bruere
Gestionnaire de scolarité
0157278233
UFR Sciences du Vivant Bâtiment Lamarck B
35 rue Hélène Brion Bureau RH38
75013 Paris